Blood test detects childhood tumors based on their epigenetic profiles

Credit: Tatjana Hirschmugl
A new study exploits the characteristic epigenetic signatures of childhood tumors to detect, classify and monitor the disease. The scientists analyzed short fragments of tumor DNA that are circulating in the blood. These "liquid biopsy" analyses exploit the unique epigenetic landscape of bone tumors and do not depend on any genetic alterations, which are rare in childhood cancers. This approach promises to improve personalized diagnostics and, possibly, future therapies of childhood tumors such as Ewing sarcoma. The study has been published in
Nature Communications.
A study led by scientists from St. Anna Children's Cancer Research Institute (St. Anna CCRI) in collaboration with CeMM Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences provides an innovative method for "liquid biopsy" analysis of childhood tumors. This method exploits the fragmentation patterns of the small DNA fragments that tumors leak into the blood stream, which reflect the unique epigenetic signature of many childhood cancers. Focusing on Ewing sarcoma, a bone tumor of children and young adults with unmet clinical need, the team led by Eleni Tomazou, PhD, St. Anna CCRI, demonstrates the method's utility for tumor classification and monitoring, which permits close surveillance of cancer therapy without highly invasive tumor biopsies.

Related Keywords

Germany ,Norway ,Austria ,Vienna ,Wien ,France ,Austrian ,Marie Bernkopf ,Sabine Taschner Mandl ,Perrine Marec ,Didier Surdez ,Bernadette Brennan ,Heidrun Boztug ,Bekir Erguner ,Elenim Tomazou ,Sabine Semper ,Manuela Krumbholz ,Sandraj Strauss ,Ingem Ambros ,Ola Myklebost ,Caroline Hutter ,Christiane Schaefer ,Nathanc Sheffield ,Susan Ann Burchill ,Michael Dworzak ,Markus Metzler ,Kjetil Boye ,Gudrun Schleiermacher ,Tatjana Hirschmugl ,Mathieu Chicard ,Daniele Barreca ,Abbas Agaimy ,Eleni Tomazou ,Peter Peneder ,Christoph Bock ,Andref Rendeiro ,Olivier Delattre ,Gaelle Pierron ,Gernot Engstler ,Peterf Ambros ,Jeremy Whelan ,Nature Communications ,University Of Vienna Meduni ,Ludwig Boltzmann Institute For Rare ,Anna Children Cancer Research Institute St ,Anna Children Cancer Research Institute ,University Of Vienna ,Cemm Research Center ,Ihanna Children ,Cancer Research Institute ,Molecular Medicine ,Austrian Academy ,Principal Investigator ,Ludwig Boltzmann Institute ,Undiagnosed Diseases ,Medical University ,Eve Lapouble ,Perrine Marec B ,Uta Dirksen ,Cancer Research ,Research Center ,General Hospital ,Meduni Vienna ,Uni Vienna ,Medicine Health ,Dancer ,Clinical Trials ,Orthopedic Medicine ,Ediatrics ,Collaboration ,Robotry Artificial Intelligence ,ஜெர்மனி ,நோர்வே ,ஆஸ்ட்ரியா ,வியன்னா ,வீந் ,பிரான்ஸ் ,ஆஸ்திரேலிய ,ஸெபீந் டாஷ்னர் மண்டல் ,பெர்னாடெட் ப்ரென்னன் ,கிறிஸ்டோஃப் போக் ,ஜெர்மி சக்கரம் ,இயற்கை தகவல்தொடர்புகள் ,அண்ணா குழந்தைகள் புற்றுநோய் ஆராய்ச்சி நிறுவனம் ,பல்கலைக்கழகம் ஆஃப் வியன்னா ,அண்ணா குழந்தைகள் ,புற்றுநோய் ஆராய்ச்சி நிறுவனம் ,மூலக்கூறு மருந்து ,ஆஸ்திரேலிய கலைக்கழகம் ,ப்ரிந்ஸிபல் புலனாய்வாளர் ,மருத்துவ பல்கலைக்கழகம் ,புற்றுநோய் ஆராய்ச்சி ,ஆராய்ச்சி மையம் ,ஜநரல் மருத்துவமனை ,யூனி வியன்னா ,மருந்து ஆரோக்கியம் ,