Single-cell CRISPR technology deciphers role of chromatin accessibility in cancer

 E-Mail
IMAGE: CRISPR-sciATAC is a novel integrative genetic screening platform that jointly captures CRISPR gene perturbations and single-cell chromatin accessibility genome-wide. The new method harnesses the programmability of the gene editing system...
view more 
Credit: Sanjana Lab of New York Genome Center and NYU
NEW YORK, NY (April 29, 2021) - In a new resource for the scientific community, published today in
Nature Biotechnology, researchers in the lab of Neville Sanjana, PhD, at the New York Genome Center (NYGC) and New York University (NYU) developed CRISPR-sciATAC, a novel integrative genetic screening platform that jointly captures CRISPR gene perturbations and single-cell chromatin accessibility genome-wide. With this technology, they profile changes in genome organization and create a large-scale atlas of how loss of individual chromatin-altering enzymes impacts the human genome. The new method harnesses the programmability of the gene editing system CRISPR to knock-out nearly all chromatin-related genes in parallel, offering researchers deeper insights into the role of DNA accessibility in cancer and in rare diseases involving chromatin.

Related Keywords

New York ,United States ,Memorial Sloan Kettering Cancer Center ,Rockefeller University ,New York University ,Cold Spring Harbor Laboratory ,Hospital For Special Surgery ,American Museum Of Natural History ,Columbia University ,Neville Sanjana ,Noa Liscovitch Brauer ,Karen Zipern ,Jay Shendure ,Sanjana Lab ,York Genome Center ,Rutgers Cancer Institute Of New Jersey ,University Of Washington ,Grossman School Of Medicine ,Roswell Park Cancer Institute ,York University ,Hackensack Meridian Health ,York Stem Cell Foundation ,Northwell Health ,Albert Einstein College Of Medicine ,Princeton University ,Stony Brook University ,Innovation Technology Lab ,Icahn School Of Medicine At Mount Sinai ,Georgetown Lombardi Comprehensive Cancer Center ,Nature Biotechnology ,New York Genome Center ,Antonino Montalbano ,Core Faculty Member ,Assistant Professor ,Albert Einstein College ,Icahn School ,Mount Sinai ,New York Presbyterian Hospital ,Weill Cornell ,American Museum ,Natural History ,Special Surgery ,New York Stem Cell Foundation ,Rutgers Cancer Institute ,Senior Director ,புதியது யார்க் ,ஒன்றுபட்டது மாநிலங்களில் ,நினைவகம் ஸ்லோன் கெட்டரிங் புற்றுநோய் மையம் ,ராக்ஃபெல்லர் பல்கலைக்கழகம் ,புதியது யார்க் பல்கலைக்கழகம் ,குளிர் வசந்த துறைமுகம் ஆய்வகம் ,மருத்துவமனை க்கு சிறப்பு அறுவை சிகிச்சை ,அமெரிக்கன் அருங்காட்சியகம் ஆஃப் இயற்கை வரலாறு ,கொலம்பியா பல்கலைக்கழகம் ,நெவில் சஞ்சனா ,ஜெய் ஷெண்டுரே ,சஞ்சனா ஆய்வகம் ,யார்க் மரபணு மையம் ,ரட்ஜர்ஸ் புற்றுநோய் நிறுவனம் ஆஃப் புதியது ஜெர்சி ,பல்கலைக்கழகம் ஆஃப் வாஷிங்டன் ,மொத்த மனிதர் பள்ளி ஆஃப் மருந்து ,ரோஸ்வெல் பூங்கா புற்றுநோய் நிறுவனம் ,யார்க் பல்கலைக்கழகம் ,ஹேக்கன்சாக் மெரிடியன் ஆரோக்கியம் ,யார்க் தண்டு செல் அடித்தளம் ,நார்த்வெல் ஆரோக்கியம் ,ஆல்பர்ட் ஐன்ஸ்டீன் கல்லூரி ஆஃப் மருந்து ,ப்ரிந்ஸ்டந் பல்கலைக்கழகம் ,ஸ்டோனி சிற்றாறு பல்கலைக்கழகம் ,கண்டுபிடிப்பு தொழில்நுட்பம் ஆய்வகம் ,இக்ஹ்ன் பள்ளி ஆஃப் மருந்து இல் ஏற்ற சினை ,ஜார்ஜ்டவுன் லோம்பார்டி விரிவான புற்றுநோய் மையம் ,இயற்கை உயிரி தொழில்நுட்பவியல் ,புதியது யார்க் மரபணு மையம் ,கோர் ஆசிரிய உறுப்பினர் ,உதவியாளர் ப்ரொஃபெஸர் ,ஆல்பர்ட் ஐன்ஸ்டீன் கல்லூரி ,இக்ஹ்ன் பள்ளி ,ஏற்ற சினை ,புதியது யார்க் ப்ரெஸ்பிடீரியந் மருத்துவமனை ,வெயில் கார்னெல் ,அமெரிக்கன் அருங்காட்சியகம் ,இயற்கை வரலாறு ,சிறப்பு அறுவை சிகிச்சை ,புதியது யார்க் தண்டு செல் அடித்தளம் ,ரட்ஜர்ஸ் புற்றுநோய் நிறுவனம் ,மூத்தவர் இயக்குனர் ,