Pemda DIY menyampaikan terjadi penambahan kasus Covid-19 DIY per 13 Juni 2021 sebanyak 466 kasus, sehingga total kasus terkonfirmasi menjadi 48.751 kasus. Kasus terkonfirmasi positif terbanyak dari Sleman 220 kasus, disusul Bantul 135 kasus, Gunungkidul 46 kasus, Jogja 37 kasus, dan Kulonprogo 28 kasus.