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DeepMind 再创里程碑,公开35万种蛋白质预测结构,这五位国内专家怎么看?

目前,AlphaFold 对于模型输入侧的同源序列信息仍然存在一定的依赖,可能会出现预测不够精确的问题;同时,对于三维结构更多依赖于异构接触(heterotypic contacts)而非链内接触或同构接触的蛋白质,也可能出现精度问题,这也是作者在论文中所提到的未来改进方向之一。 在 AlphaFold(以及David Baker组的RoseTTAFold)发布之前,国内已有一些将端到端学习引入到蛋白质结构预测中的初步尝试(包括我们tFold),在预测精度方面,基本可以达到与CASP14中排名第二的Baker组相仿的水平,但与AlphaFold 仍存在一定差距。在 AlphaFold 论文及代码公开后,相信国内这方面的研究将在短期内迎来较大的提升幅度。 在蛋白质结构预测领域,AlphaFold 的出现,在一定程度上降低了基于实验数据的蛋白质结构测定的工作量;同时,通过结合真实实验数据和 AlphaFold 预测出的�

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