La circulación de la variante endémica del SARS-CoV-2 (A.2.5) en el país fue desplazada por la variante de preocupación Alfa (B.1.1.7), que emergió en el Reino Unido.
Los últimos análisis genómicos realizados por el Instituto Conmemorativo Gorgas de Estudios de la Salud (Icges) muestran que en la secuenciación de genomas han encontrado que un 29.1% de los casos corresponde a la variante Alfa, y 4.7%, a la endémica. Hace unas semanas, el 34.7% de los casos era de la A.2.5.
En el país también circula la variante Gamma (P.1) y otras de interés, como Lambda (C.37), de origen andino, y la B.1.621 (Colombia).