Bakteriophagen sind jeweils spezialisiert auf eine Bakterienart, oder sogar auf einzelne Stämme innerhalb einer Art. Das ist zum Beispiel bei Darmerkrankungen wie dem Reizdarmsyndrom vorteilhaft, weil Bakteriophagen - anders als Antibiotika - die guten Bakterien der Darmflora unbehelligt lassen und keine entsprechenden Nebenwirkungen verursachen. Ein Nachteil ist genau das allerdings in der täglichen Praxis: Um den richtigen Phagen auszuwählen, muss man erst analysieren, welches Bakterium die Beschwerden auslöst. Das dauert einige Zeit: Man muss eine Probe nehmen, die Bakterien vermehren und analysieren. Um diese Verzögerung zu vermeiden, werden zunächst Mischungen von Phagen gegen häufige Bakterien eingesetzt. Sie erzielen aber nicht immer die gewünschte Wirkung, zum Beispiel bei den gefürchteten antibiotikaresistenten Staphylokokken - den auch als MRSA bekannten multiresistenten Keimen, die immer wieder als sogenannte Krankenhauskeime auftreten. Einem Team aus österreic