Sehari-sehari bertugas melakukan patroli kewilayahan untuk memastikan keamanan dan ketertiban masyarakat di wilayah hukumnya, berada di daerah perbatasan dari negara Republik Indonesia (RI) dengan negara tetangga Papua New Gunea (PNG).
Pakar hukum laut mengatakan tanpa sinergi patroli laut bersama Bakamla, terjadi tumpang-tindih wilayah patroli di wilayah tertentu, sementara daerah lainnya tidak diawasi dan rawan pelanggaran.