Untuk menjalankan program tersebut, pemerintah pusat membutuhkan dana tambahan dari pemerintah daerah sebagai pendamping, sehingga kolaborasi itu bisa optimal.
Saat ini Kementerian PUPR sedang membangun 700 unit hunian tetap di Kabupaten Lembata dan Adonara sesuai instruksi Presiden. Selain itu, Kementerian PUPR juga membangun 300 unit hunian tetap di Kabupaten Flores Timur.